查询犯罪记录的单位主要是 国家行政单位，包括公安机关、国家安全机关、人民检察院和司法行政机关。这些机关负责受理、审核和处理有关犯罪记录的查询申请。
对于普通公司而言，一般情况下是不允许查询员工个人的犯罪记录的。犯罪记录属于个人隐私，公安机关未经特殊法定程序是不允许查询的。只有在特殊情况下，如员工涉及特殊职业或入伍等，经过法定程序才可能进行查询。
此外，有些国有企业和特定行业（如证券、金融、法律）可能要求在入职时提供《无违法犯罪记录证明》，但这并不是公司主动查询员工的犯罪记录，而是员工需要自行提供相关证明。
综上所述，查询犯罪记录的主要是国家行政单位，而普通公司通常没有这个权限，除非在特殊情况下遵循法定程序进行查询。
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