海关对免税商品进行查验的原因主要包括以下几点：
确保合规性：
海关需要确保旅客遵守相关免税政策，防止旅客通过免税商品进行走私或逃税行为。
防止违禁品进入：
通过X光检查等手段，海关可以发现行李中可能携带的违禁品，如动植物制品、武器等。
监督物品申报：
旅客必须如实填写《进出境行李物品申报单》，海关通过此单据监督旅客的申报行为。
国家安全：
海关还负责身份验证，确保入境人员合法，防止非法移民或被通缉人员进入。
监管减免税货物：
特定减免税货物在海关监管期限内不能移作他用，如转让或买卖，以确保税款征收和减免税政策得到正确执行。
因此，即使商品是免税的，海关仍然需要进行查验，以维护国家利益和社会安全
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