当学生在学校死亡时，应当采取以下步骤处理：
及时报警
一旦发现学生死亡，应立即拨打110报警，告知警方发生的情况，并请求警方保护现场，避免破坏任何可能有助于调查的证据。
通知学生家属
学校应立即通知学生家属，并协助他们尽快到达现场。家属有权了解事件的详细情况，并应尽快安排葬礼。
报告上级主管部门
学校应向上级教育主管部门报告事件，请求他们派人调查，并提供必要的支持和协助。这有助于确保事件的公正处理，并防止类似事件再次发生。
配合派出所工作
学校应请求当地派出所配合，做好教学秩序的稳定工作，防止因事件处理不当而影响学校的正常运作。
尸检
如果家属对死亡原因有疑问，可以要求进行尸检。学校应积极配合家属，提供必要的协助，确保尸检过程顺利进行。
调查结论
学校应对事件进行调查，并尽快给家属一个明确的调查结论。如果学校存在过错，应承担相应的赔偿责任；如果是第三人造成的，则由第三人和学校共同承担责任。
法律责任
根据《中华人民共和国民法典》和《学生伤害事故处理办法》，学校对未成年学生承担教育保护责任，对在校发生的伤害事件承担过错责任。如果学校未尽到教育和管理职责，导致学生死亡，应承担相应的法律责任。
经济补助
对于家庭确有困难的学生家属，学校可以酌情给予一次性经济补助。具体补助金额和方式应与家属协商，并参照国家有关规定执行。
后续处理
在事件处理结束后，学校应及时总结教训，加强校园安全管理，防止类似事件再次发生。同时，学校应积极配合家属处理后续事宜，包括提供必要的心理辅导和支持。
通过以上步骤，可以确保学生死亡事件得到妥善处理，同时维护学校的正常秩序和学生的权益。
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