学校档案的管理部门主要 是学校档案馆或相关学生管理部门。具体管理职责如下：
中小学 ：一般由教务处主管。
大学
学生档案一般由学生处或档案室主管。
档案归口管理部门包括大学人事处（部）、大学教务处（部）和大学学生工作部（处）。
档案在新生入学后由院系保管，整理后统一转交到学校档案馆。
因此，无论是中小学还是大学，档案的管理部门主要隶属于学校的教务部门或学生管理部门，具体职责可能因学校规模、性质等因素有所不同。建议您在具体操作前，咨询所在学校的相关部门以获取最准确的信息。
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